Pakiet: sniffles (1.0.12b+ds-1)

[ Pakiet źródłowy: sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Inne pakiety związane z sniffles

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

Pobieranie sniffles

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	703,3 KiB	1 100,0 KiB	[lista plików]
arm64	681,9 KiB	1 040,0 KiB	[lista plików]
armel	674,2 KiB	1 027,0 KiB	[lista plików]
armhf	680,5 KiB	899,0 KiB	[lista plików]
i386	717,0 KiB	1 127,0 KiB	[lista plików]
mips64el	680,8 KiB	1 166,0 KiB	[lista plików]
mipsel	682,9 KiB	1 147,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	707,2 KiB	1 196,0 KiB	[lista plików]
s390x	679,3 KiB	1 100,0 KiB	[lista plików]