Balík: covtobed (1.3.5+dfsg-2) [debports]

[ Zdroj:  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libunwind8

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: zlib1g

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť covtobed

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ia64 (neoficiálny port)	57.1 kB	240.0 kB	[zoznam súborov]