Paketti: covtobed (1.3.5+dfsg-2) [debports]

[ Source:  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Muut pakettiin covtobed liittyvät paketit

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi covtobed

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
ia64 (epävirallinen siirros)	57.1 kt	240.0 kt	[tiedostoluettelo]