všetky možnosti
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Zdroj: maffilter  ]

Balík: maffilter (1.3.1+dfsg-1 a iné)

Odkazy pre maffilter

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík maffilter:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

process genome alignment in the Multiple Alignment Format

MafFilter applies a series of "filters" to a MAF file, in order to clean it, extract data and computer statistics while keeping track of the associated meta-data such as genome coordinates and quality scores.

 * It can process the alignment to remove low-quality / ambiguous /
   masked regions.
 * It can export data into a single or multiple alignment file in
   format such as Fasta or Clustal.
 * It can read annotation data in GFF or GTF format, and extract the
   corresponding alignment.
 * It can perform sliding windows calculations.
 * It can reconstruct phylogeny/genealogy along the genome alignment.
 * It can compute population genetics statistics, such as site
   frequency spectrum, number of fixed/polymorphic sites, etc.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom maffilter

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť maffilter

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Verzia Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 1.3.1+dfsg-1+b1 210.3 kB847.0 kB [zoznam súborov]
arm64 1.3.1+dfsg-1+b1 189.9 kB795.0 kB [zoznam súborov]
armhf 1.3.1+dfsg-1+b1 179.7 kB554.0 kB [zoznam súborov]
i386 1.3.1+dfsg-1+b1 213.4 kB806.0 kB [zoznam súborov]