Balík: nast-ier (20101212+dfsg1-4)

[ Zdroj: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom nast-ier

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie arm64, ppc64el]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Stiahnuť nast-ier

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	20.7 kB	100.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	20.5 kB	95.0 kB	[zoznam súborov]
armel	20.0 kB	95.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	19.9 kB	91.0 kB	[zoznam súborov]
i386	21.0 kB	99.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	21.3 kB	101.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	21.0 kB	96.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	21.4 kB	148.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	20.7 kB	95.0 kB	[zoznam súborov]