Balík: ngmlr (0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2 a iné)

Odkazy pre ngmlr

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík ngmlr:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

CoNvex Gap-cost alignMents for Long Reads

Ngmlr is a long-read mapper designed to sensitively align PacBilo or Oxford Nanopore to (large) reference genomes. It was designed to quickly and correctly align the reads, including those spanning (complex) structural variations. Ngmlr uses an SV aware k-mer search to find approximate mapping locations for a read and then a banded Smith- Waterman alignment algorithm to compute the final alignment. Ngmlr uses a convex gap cost model that penalizes gap extensions for longer gaps less than for shorter ones to compute precise alignments.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ngmlr

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libssw0 (>= 1.1)

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: libstdc++6 (>= 11)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť ngmlr

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	673.7 kB	1,157.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	653.3 kB	1,173.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	648.7 kB	1,172.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	649.2 kB	1,044.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	680.7 kB	1,184.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	657.3 kB	1,260.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	660.6 kB	1,256.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	677.5 kB	1,301.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1	655.1 kB	1,173.0 kB	[zoznam súborov]