[ Zdroj: concavity ]
Balík: concavity (0.1+dfsg.1-5)
Odkazy pre concavity
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík concavity:
- [concavity_0.1+dfsg.1-5.dsc]
- [concavity_0.1+dfsg.1.orig.tar.xz]
- [concavity_0.1+dfsg.1-5.debian.tar.xz]
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Laszlo Kajan (Stránka QA)
- Andreas Tille (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [compbio.cs.princeton.edu]
Podobné balíky:
predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation
ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.
ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.
The following result files are produced by default:
* Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores). * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb). * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx). * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).
Ostatné balíky súvisiace s balíkom concavity
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- sug: conservation-code
- protein sequence conservation scoring tool
-
- sug: pymol
- systém na vykresľovanie molekúl
Stiahnuť concavity
Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|
i386 | 252.5 kB | 1,020.0 kB | [zoznam súborov] |