[ Source: concavity ]
Paketti: concavity (0.1+dfsg.1-5)
Links for concavity
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti concavity:
- [concavity_0.1+dfsg.1-5.dsc]
- [concavity_0.1+dfsg.1.orig.tar.xz]
- [concavity_0.1+dfsg.1-5.debian.tar.xz]
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Laszlo Kajan (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [compbio.cs.princeton.edu]
Samankaltaisia paketteja:
predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation
ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.
ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.
The following result files are produced by default:
* Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores). * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb). * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx). * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).
Muut pakettiin concavity liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- sug: conservation-code
- protein sequence conservation scoring tool
-
- sug: pymol
- Molecular Graphics System
Imuroi concavity
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
i386 | 252.5 kt | 1,020.0 kt | [tiedostoluettelo] |