Balík: ampliconnoise (1.29-10 a iné)

[ Zdroj: ampliconnoise  ]

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons

AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:

Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences

Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.

Značky: Role: Program

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ampliconnoise

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

• dep: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• rec: openmpi-bin

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory

Stiahnuť ampliconnoise

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1.29-10+b2	1,085.5 kB	2,041.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.29-10+b2	1,074.0 kB	2,401.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.29-10+b2	1,068.5 kB	2,388.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.29-10+b2	1,062.3 kB	2,388.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.29-10+b2	1,079.4 kB	2,000.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.29-10+b2	1,075.7 kB	2,423.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	1.29-10+b2	1,075.4 kB	2,410.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.29-10+b2	1,097.9 kB	3,105.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.29-10+b2	1,076.4 kB	2,005.0 kB	[zoznam súborov]