Paquet : density-fitness (1.0.12-2)

[ Paquet source : density-fitness  ]

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Autres paquets associés à density-fitness

• dep: libc6 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libcifpp7 (>= 7.0.7)

  Library files for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.1.5)

  Library file for libpdb-redo

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8)

  Library file for libzeep

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger density-fitness

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	482,4 ko	5 862,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	476,9 ko	5 910,0 ko	[liste des fichiers]
armel	475,7 ko	5 841,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	475,7 ko	5 813,0 ko	[liste des fichiers]
i386	485,6 ko	5 865,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	480,7 ko	5 918,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	482,5 ko	5 910,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	481,0 ko	5 834,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	481,1 ko	5 866,0 ko	[liste des fichiers]