Пакет: biobambam2 (2.0.185+ds-2)

[ Источник: biobambam2  ]

tools for early stage alignment file processing

This package contains some tools for processing BAM files, including

  bamsormadup:  parallel sorting and duplicate marking
  bamcollate2:  reads BAM and writes BAM reordered such that alignment
                or collated by query name
  bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments
                marked using the BAM flags field
  bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits
                from the flags column
  bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression
                 setting. This tool is capable of multi-threading.
  bamsort:       reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or
                 query name
  bamtofastq:    reads BAM and writes FastQ; output can be collated
                 or uncollated by query name

Другие пакеты, относящиеся к biobambam2

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [не i386, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libmaus2-2 (>= 2.0.813+ds)

  collection of data structures and algorithms for biobambam

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка biobambam2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	9 203,8 Кб	64 327,0 Кб	[список файлов]
i386	9 933,6 Кб	71 707,0 Кб	[список файлов]
mips64el	7 602,0 Кб	75 740,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	8 944,3 Кб	76 579,0 Кб	[список файлов]
riscv64	8 815,6 Кб	51 675,0 Кб	[список файлов]