Пакет: ataqv (1.3.1+ds-2 и другие)

[ Источник: ataqv  ]

ATAC-seq QC and visualization

A toolkit for measuring and comparing ATAC-seq results, made in the Parker lab at the University of Michigan. They wrote it to help understand how well their ATAC-seq assays had worked, and to make it easier to spot differences that might be caused by library prep or sequencing.

Теги: Инструментарий интерфейса: Ncurses TUI

Другие пакеты, относящиеся к ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  iconic font designed for use with Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  библиотека Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.34) [не arm64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libjs-jquery

  JavaScript library for dynamic web applications

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery plug-in that makes nice tables from different data sources

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  разделяемые библиотеки для управления терминалом

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не arm64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  Modern alternative to CSS resets

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• sug: macs

  Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

• sug: picard-tools

  Command line tools to manipulate SAM and BAM files

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: wget

  загрузка файлов из сети

Загрузка ataqv

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1.3.1+ds-2+b2	3 320,5 Кб	6 526,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.3.1+ds-2+b3	3 257,8 Кб	6 465,0 Кб	[список файлов]
armel	1.3.1+ds-2+b2	3 238,7 Кб	6 232,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.3.1+ds-2+b2	3 246,5 Кб	5 848,0 Кб	[список файлов]
i386	1.3.1+ds-2+b2	3 357,6 Кб	6 603,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.3.1+ds-2+b2	3 249,9 Кб	6 868,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.3.1+ds-2+b2	3 296,8 Кб	6 723,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.3.1+ds-2+b2	3 311,8 Кб	6 207,0 Кб	[список файлов]