Пакет: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-3 и другие) [non-free]

[ Источник: cufflinks  ]

Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.

Теги: Биология: Нуклеиновые кислоты, Область: Биология, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Роль: Программа, Работает с: Биологические последовательности

Другие пакеты, относящиеся к cufflinks

• dep: libboost-serialization1.67.0

  serialization library for C++

• dep: libboost-system1.67.0

  Operating system (e.g. diagnostics support) library

• dep: libboost-thread1.67.0

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.23)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: python

  интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  библиотека сжатия

• enh: tophat

  fast splice junction mapper for RNA-Seq reads

Загрузка cufflinks

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
i386	2.2.1+dfsg.1-3+b1	1 494,9 Кб	10 392,0 Кб	[список файлов]