Пакет: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-9) [non-free]
Ссылки для cufflinks
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код cufflinks:
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-9.dsc]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1.orig.tar.gz]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-9.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Alexandre Mestiashvili (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Charles Plessy (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [cufflinks.cbcb.umd.edu]
Подобные пакеты:
Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.
This package provides the binary of cufflinks and associated tools, i.e. compress_gtf, cuffcompare, cuffdiff, cuffmerge, cuffnorm, cuffquant and gtf_to_sam.
Другие пакеты, относящиеся к cufflinks
|
|
|
|
-
- dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)
- serialization library for C++
-
- dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)
- portable C++ multi-threading
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 7)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- библиотека сжатия
-
- rec: gffread
- GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction
-
- enh: tophat
- Пакет недоступен
Загрузка cufflinks
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
i386 | 1 517,8 Кб | 10 470,0 Кб | [список файлов] |