Package: hmmer (3.4+dfsg-2)

[ Source: hmmer  ]

Modelos Markov de perfil escondido para análises de sequências de proteínas

HMMER é uma implementação de métodos modelo Markov de perfil escondido para buscas sensitivas de bases de dados de sequências biológicas usando alinhamentos de sequências múltiplas como consultas.

Fornecendo um alinhamento de sequência múltipla como entrada, o HMMER constrói um modelo estatístico chamado um "modelo Markov escondido" que pode depois ser usado como uma consulta a uma base de dados de sequências para encontrar (e/ou alinhar) homólogos adicionais da família da sequência.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::searching, works-with-format::plaintext, Works with: Databases

Other Packages Related to hmmer

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

Download hmmer

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	1,068.1 kB	6,187.0 kB	[list of files]