Package: hmmer (3.3.2+dfsg-1)

[ Source: hmmer  ]

Modelos Markov de perfil escondido para análises de sequências de proteínas

HMMER é uma implementação de métodos modelo Markov de perfil escondido para buscas sensitivas de bases de dados de sequências biológicas usando alinhamentos de sequências múltiplas como consultas.

Fornecendo um alinhamento de sequência múltipla como entrada, o HMMER constrói um modelo estatístico chamado um "modelo Markov escondido" que pode depois ser usado como uma consulta a uma base de dados de sequências para encontrar (e/ou alinhar) homólogos adicionais da família da sequência.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::searching, works-with-format::plaintext, Works with: Databases

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• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
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• sug: hmmer-doc (>= 3.3.2+dfsg-1)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

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