Alinhamento de múltiplas sequências baseado em segmentação
DIALIGN-TX é uma ferramenta da linha de comandos para realizar o múltiplo
alinhamento de proteínas ou sequências de DNA. É uma completa
re-implementação da abordagem da base de segmentação incluindo vários
novos melhoramentos e heurísticas que significativamente melhoram a
qualidade da produção de alinhamentos, em comparação com DIALIGN 2.2 e
DIALIGN-T. Para alinhamento pareado, o DIALIGN-TX usa um algoritmo de
fragmentação em cadeia que favorece as cadeias de alinhamentos locais de
baixa pontuação sobre os fragmentos isolados de alta pontuação. Para
múltiplos alinhamentos, o DIALIGN-TX usa um procedimento melhorado e
ganancioso que é menos sensível a semelhanças de sequências locais falsas.
