alinhador de seqüências múltiplas baseado em segmentos
DIALIGN-TX é uma ferramenta em linha de comando para realizar alinhamento
múltiplo de proteínas ou seqüências de DNA. Ele é uma reimplementação
completa da abordagem baseada em segmentos incluindo várias novas melhorias
e heurísticas que aumenta significativamente a qualidade dos alinhamentos
retornados comparado com DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Para alinhamento aos
pares, DIALIGN-TX usa um algoritmo de cadeias de segmentos que favorece
cadeias de alinhamentos locais de baixa pontuação em detrimento de
fragmentos isolados de alta pontuação. Para alinhamentos múltiplos,
DIALIGN-TX usa um procedimento voraz (greedy) melhorado que é menos
sensível a similaridades de seqüências locais falsas.
