Package: apbs (1.4-1 and others)

[ Source: apbs  ]

Resolvedor adaptativo de Poisson Boltzmann

O APBS é um pacote de software para a solução numérica da equação de Poisson-Boltzmann (PBE), um dos mais populares modelos contínuos para descrever as interacções electrostáticas entre solutos moleculares em sal, em meio aquoso. A electrostática contínua desempenha um papel importante em várias áreas da simulação biomolecular, incluindo:

   * simulação de processos de difusão para determinar ligações cinéticas
     de ligante-proteína e proteína-proteína,
   * dinâmicas implícitas de solvente molecular de biomoléculas,
   * solvatação e cálculos de ligações de energia para determinar
     constantes de ligação de equilíbrio de ligante-proteína e proteína-
     proteína e ajuda na concepção racional do medicamento,
   * e estudos de titulação biomolecular.

O APBS foi desenhado para avaliar eficientemente propriedades electrostáticas para tais simulações, com uma vasta gama de comprimento de escalas para permitir a investigação de moléculas com dezenas a milhões de átomos.

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility

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