Package: mummer (3.23+dfsg-7)
Links for mummer
Debian Resources:
Download Source Package mummer:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
External Resources:
- Homepage [mummer.sourceforge.net]
Similar packages:
Alinhamento eficiente de sequências de genomas completos
MUMmer é um sistema para alinhamento rápido de genomas completos, seja em forma completa ou rascunho. Por exemplo, O MUMmer 3.0 consegue encontrar todas as base-par-20 ou equivalências exactas mais longas entre um par de genomas base-mega-5 em 13.7 segundos, usando 78MB de memória, num computador com ambiente de trabalho Linux a 2.4Ghz. O MUMmer também consegue alinhar genomas incompletos; lida com os 100s ou 1000s de 'contigs' a partir dum projecto de sequência dupla paralela (shotgun) com facilidade, e irá alinhá-los com outro conjunto de 'contigs' ou um genoma usando o programa NUCmer incluído com o sistema. Se as espécies forem muito divergentes para que o alinhamento de sequência DNA detecte semelhanças, então o programa PROmer pode gerar alinhamentos baseados nas translações do sexto-quadro de ambas as sequências inseridas.
Other Packages Related to mummer
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- dep: gawk
- awk do GNU, uma sondagem de padrões e linguagem de processamento
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Biblioteca de suporte do GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Biblioteca C++ padrão GNU v3
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- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
Download mummer
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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mips64el | 655.4 kB | 3,535.0 kB | [list of files] |