Balík: mummer (3.23+dfsg-7)
Odkazy pre mummer
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík mummer:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Steffen Moeller (Stránka QA)
- Andreas Tille (Stránka QA)
- Charles Plessy (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [mummer.sourceforge.net]
Podobné balíky:
Efficient sequence alignment of full genomes
MUMmer is a system for rapidly aligning entire genomes, whether in complete or draft form. For example, MUMmer 3.0 can find all 20-basepair or longer exact matches between a pair of 5-megabase genomes in 13.7 seconds, using 78 MB of memory, on a 2.4 GHz Linux desktop computer. MUMmer can also align incomplete genomes; it handles the 100s or 1000s of contigs from a shotgun sequencing project with ease, and will align them to another set of contigs or a genome using the NUCmer program included with the system. If the species are too divergent for DNA sequence alignment to detect similarity, then the PROmer program can generate alignments based upon the six-frame translations of both input sequences.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom mummer
|
|
|
|
-
- dep: gawk
- GNU awk, jazyk na hľadanie a spracovanie vzoriek
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: perl
- Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
Stiahnuť mummer
Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|
mips64el | 655.4 kB | 3,535.0 kB | [zoznam súborov] |