Package: dialign-tx (1.0.2-13)

[ Source: dialign-t  ]

Alinhamento de múltiplas sequências baseado em segmentação

DIALIGN-TX é uma ferramenta da linha de comandos para realizar o múltiplo alinhamento de proteínas ou sequências de DNA. É uma completa re-implementação da abordagem da base de segmentação incluindo vários novos melhoramentos e heurísticas que significativamente melhoram a qualidade da produção de alinhamentos, em comparação com DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Para alinhamento pareado, o DIALIGN-TX usa um algoritmo de fragmentação em cadeia que favorece as cadeias de alinhamentos locais de baixa pontuação sobre os fragmentos isolados de alta pontuação. Para múltiplos alinhamentos, o DIALIGN-TX usa um procedimento melhorado e ganancioso que é menos sensível a semelhanças de sequências locais falsas.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-13)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	80.2 kB	204.0 kB	[list of files]
arm64	84.5 kB	188.0 kB	[list of files]
armel	68.1 kB	184.0 kB	[list of files]
armhf	65.1 kB	136.0 kB	[list of files]
i386	76.9 kB	204.0 kB	[list of files]
mips64el	97.5 kB	244.0 kB	[list of files]
mipsel	89.0 kB	211.0 kB	[list of files]
ppc64el	95.4 kB	277.0 kB	[list of files]
s390x	72.4 kB	200.0 kB	[list of files]