[ Source: mafft ]
Package: mafft (7.475-1)
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- Homepage [mafft.cbrc.jp]
Similar packages:
Programa de múltiplos alinhamentos para amino ácidos ou sequências nucleotídeas
MAFFT é um programa de alinhamento de múltiplas sequências que oferece três métodos orientados a precisão:
* L-INS-i (provavelmente o mais preciso; recomendado para <200sequências;
método de refinação iterativo incorporando informação de alinhamento pairwise), * G-INS-i (apropriado para sequências de comprimentos semelhantes; recomendado para <200 sequências; método de reginação iteractivo incorporando informação de alinhamento pairwise), * E-INS-i (apropriado para sequências que contếm grandes secções não alinháveis, recomendado para <200 sequências),e cinco métodos orientados à velocidade:
* FFT-NS-i ⁽método de refinação iterativo; apenas dois ciclos), * FFT-NS-i (método de refinação iterativo; máximo 1000 iterações), * FFT-NS-2 (rápido, método progressivo), * FFT-NS-1 (muito rápido, recomendado para >2000 sequências; método progressivo com uma árvore de guia rude), * NW-NS-PartTree-1 (recomendado para ~50,000 sequências; método progressivo com o algoritmo PartTree).
Other Packages Related to mafft
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
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- rec: blast2
- Package not available
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- rec: libwww-perl
- Interface simples e consistente para a world-wide web
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- rec: lynx
- classic non-graphical (text-mode) web browser
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- rec: ruby
- Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)
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- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
Download mafft
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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amd64 | 1,026.2 kB | 11,507.0 kB | [list of files] |