Pacote: skewer (0.2.2-6 e outros)

[ Fonte: skewer  ]

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Outros pacotes relacionados a skewer

• dep: libc6 (>= 2.34) [não arm64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf, i386]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

Download de skewer

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	0.2.2-6+b1	86.4 kB	216.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.2.2-6+b2	79.1 kB	236.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.2.2-6+b1	75.2 kB	235.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.2.2-6+b1	75.5 kB	171.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.2.2-6+b1	90.2 kB	231.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.2.2-6+b1	81.5 kB	242.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.2.2-6+b1	84.9 kB	236.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.2.2-6+b1	80.3 kB	159.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.2.2-6+b1	76.0 kB	199.0 kB	[lista de arquivos]