套件：skewer（0.2.2-6 以及其他的）

[ 原始碼： skewer  ]

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

其他與 skewer 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 arm64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 armel, armhf, i386]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ Library v3

下載 skewer

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
amd64	0.2.2-6+b1	86。4 kB	216。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.2.2-6+b2	79。1 kB	236。0 kB	[檔案列表]
armel	0.2.2-6+b1	75。2 kB	235。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.2.2-6+b1	75。5 kB	171。0 kB	[檔案列表]
i386	0.2.2-6+b1	90。2 kB	231。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.2.2-6+b1	81。5 kB	242。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.2.2-6+b1	84。9 kB	236。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.2.2-6+b1	80。3 kB	159。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.2.2-6+b1	76。0 kB	199。0 kB	[檔案列表]