Pacote: gsort (0.1.4-3 e outros)

[ Fonte: gsort  ]

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Outros pacotes relacionados a gsort

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

Download de gsort

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	0.1.4-3+b22	2,228.3 kB	6,715.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.1.4-3+b22	1,909.3 kB	6,268.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.1.4-3+b22	1,987.9 kB	6,609.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.1.4-3+b22	1,979.8 kB	6,545.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.1.4-3+b22	2,155.3 kB	6,554.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.1.4-3+b22	1,812.6 kB	7,374.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.1.4-3+b22	1,905.5 kB	6,523.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.1.4-3+b11	1,983.5 kB	6,395.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.1.4-3+b22	2,029.0 kB	7,035.0 kB	[lista de arquivos]