Pakiet: gsort (0.1.4-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: gsort  ]

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Inne pakiety związane z gsort

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

Pobieranie gsort

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.1.4-3+b18	2 138,3 KiB	6 309,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.1.4-3+b18	1 843,3 KiB	5 989,0 KiB	[lista plików]
armel	0.1.4-3+b18	1 822,2 KiB	6 204,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.1.4-3+b18	1 815,9 KiB	6 076,0 KiB	[lista plików]
i386	0.1.4-3+b18	1 989,2 KiB	6 132,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.1.4-3+b18	1 655,4 KiB	6 840,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.1.4-3+b18	1 834,9 KiB	6 180,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.1.4-3+b7	1 815,6 KiB	5 925,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.1.4-3+b18	1 949,2 KiB	6 629,0 KiB	[lista plików]