Package: gsort (0.1.4-3 and others)

[ Source: gsort  ]

Sorter genomiske data

Gsort er et værktøj til at sortere genomiske filer jævnfør en genomfil. For eksempel, for at sortere VCF til rækkefølgeordning: X, Y, 2, 1, 3, ... og teksthovedet skal være øverst.

Et mere sandsynligt eksempel, hvis en fil skal sorteres for at matche GATK-rækkefølgen (1 ... X, Y, MT), hvilket ikke er muligt med noget sorteringsværktøj. Med gsort kan man bare placere MT som det sidste kromosom i ».genome«-filen.

Vil også være nyttig for at hente filer klar til brug i bedtools.

Other Packages Related to gsort

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

Download gsort

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.1.4-3+b18	2,138.3 kB	6,309.0 kB	[list of files]
arm64	0.1.4-3+b18	1,843.3 kB	5,989.0 kB	[list of files]
armel	0.1.4-3+b18	1,822.2 kB	6,204.0 kB	[list of files]
armhf	0.1.4-3+b18	1,815.9 kB	6,076.0 kB	[list of files]
i386	0.1.4-3+b18	1,989.2 kB	6,132.0 kB	[list of files]
mips64el	0.1.4-3+b18	1,655.4 kB	6,840.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.1.4-3+b18	1,834.9 kB	6,180.0 kB	[list of files]
riscv64	0.1.4-3+b7	1,815.6 kB	5,925.0 kB	[list of files]
s390x	0.1.4-3+b18	1,949.2 kB	6,629.0 kB	[list of files]