Package: gsort (0.1.4-3 and others)

[ Source: gsort  ]

Sorter genomiske data

Gsort er et værktøj til at sortere genomiske filer jævnfør en genomfil. For eksempel, for at sortere VCF til rækkefølgeordning: X, Y, 2, 1, 3, ... og teksthovedet skal være øverst.

Et mere sandsynligt eksempel, hvis en fil skal sorteres for at matche GATK-rækkefølgen (1 ... X, Y, MT), hvilket ikke er muligt med noget sorteringsværktøj. Med gsort kan man bare placere MT som det sidste kromosom i ».genome«-filen.

Vil også være nyttig for at hente filer klar til brug i bedtools.

Other Packages Related to gsort

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

Download gsort

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.1.4-3+b20	2,231.6 kB	6,719.0 kB	[list of files]
arm64	0.1.4-3+b20	1,913.7 kB	6,267.0 kB	[list of files]
armel	0.1.4-3+b20	1,988.1 kB	6,609.0 kB	[list of files]
armhf	0.1.4-3+b20	1,981.6 kB	6,545.0 kB	[list of files]
i386	0.1.4-3+b20	2,159.9 kB	6,566.0 kB	[list of files]
mips64el	0.1.4-3+b20	1,811.3 kB	7,374.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.1.4-3+b20	1,908.5 kB	6,523.0 kB	[list of files]
riscv64	0.1.4-3+b9	1,982.6 kB	6,395.0 kB	[list of files]
s390x	0.1.4-3+b20	2,028.8 kB	7,035.0 kB	[list of files]