Pacote: r-bioc-dnacopy (1.80.0-2 e outros)

[ Fonte: r-bioc-dnacopy  ]

R package: DNA copy number data analysis

Implements the circular binary segmentation (CBS) algorithm to segment DNA copy number data and identify genomic regions with abnormal copy number.

This package is for analyzing array DNA copy number data, which is usually (but not always) called array Comparative Genomic Hybridization (array CGH) data It implements a methodology for finding change-points in these data which are points after which the (log) test over reference ratios have changed location. This model is that the change-points correspond to positions where the underlying DNA copy number has changed. Therefore, change-points can be used to identify regions of gained and lost copy number. Also provided is a function for making relevant plots of these data.

Outros pacotes relacionados a r-bioc-dnacopy

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [não alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgfortran5 (>= 10)

  biblioteca de execução para aplicações GNU Fortran

• dep: r-api-4.0

  pacote virtual fornecido por r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Pacote não disponível

• dep: r-api-bioc-3.20 [não hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  pacote virtual fornecido por r-bioc-biocgenerics

Download de r-bioc-dnacopy

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.80.0-2	486.5 kB	621.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.80.0-2	486.7 kB	609.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.80.0-2	484.6 kB	621.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.76.0-1	369.0 kB	506.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.76.0-1	376.4 kB	567.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.80.0-2	485.3 kB	621.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.76.0-1	367.0 kB	505.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.80.0-2	485.9 kB	622.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.80.0-2	489.8 kB	622.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.80.0-2	488.6 kB	621.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.80.0-2	486.8 kB	593.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.80.0-2	489.2 kB	605.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.76.0-1	373.1 kB	529.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.80.0-2	483.9 kB	1,582.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.76.0-1	370.3 kB	509.0 kB	[lista de arquivos]