Paketti: r-bioc-dnacopy (1.78.0-1 ja muut)

[ Source: r-bioc-dnacopy  ]

R package: DNA copy number data analysis

Implements the circular binary segmentation (CBS) algorithm to segment DNA copy number data and identify genomic regions with abnormal copy number.

This package is for analyzing array DNA copy number data, which is usually (but not always) called array Comparative Genomic Hybridization (array CGH) data It implements a methodology for finding change-points in these data which are points after which the (log) test over reference ratios have changed location. This model is that the change-points correspond to positions where the underlying DNA copy number has changed. Therefore, change-points can be used to identify regions of gained and lost copy number. Also provided is a function for making relevant plots of these data.

Muut pakettiin r-bioc-dnacopy liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [ei alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgfortran5 (>= 10)

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: r-api-4.0

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Paketti ei saatavilla

• dep: r-api-bioc-3.19 [ei hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-bioc-biocgenerics

Imuroi r-bioc-dnacopy

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.78.0-1	368.8 kt	526.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.78.0-1	368.9 kt	514.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.78.0-1	367.0 kt	526.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.76.0-1	369.0 kt	506.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.76.0-1	376.4 kt	567.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.76.0-1	367.0 kt	505.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.78.0-1	368.2 kt	527.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.78.0-1	372.2 kt	527.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.78.0-1	370.9 kt	526.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.78.0-1	369.1 kt	498.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.78.0-1	371.4 kt	510.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.76.0-1	373.1 kt	529.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.78.0-1	366.3 kt	1,487.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.76.0-1	370.3 kt	509.0 kt	[tiedostoluettelo]