Pacote: maqview (0.2.5-12 e outros)

[ Fonte: maqview  ]

graphical read alignment viewer for short gene sequences

Maqview is graphical read alignment viewer. It is specifically designed for the Maq alignment file and allows you to see the mismatches, base qualities and mapping qualities. Maqview is nothing fancy as Consed or GAP, but just a simple viewer for you to see what happens in a particular region.

In comparison to tgap-maq, the text-based read alignment viewer written by James Bonfield, Maqview is faster and takes up much less memory and disk space in indexing. This is possibly because tgap aims to be a general-purpose viewer but Maqview fully makes use of the fact that a Maq alignment file has already been sorted. Maqview is also efficient in viewing and provides a command-line tool to quickly retrieve any region in an Maq alignment file.

Outros pacotes relacionados a maqview

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sh4, sparc64]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgl1

  biblioteca de despacho GL independente de fornecedor(a) - - suporte legado GL

• dep: libglu1-mesa

  Mesa OpenGL utility library (GLU)

  ou libglu1

  pacote virtual fornecido por libglu1-mesa

• dep: libglut3.12 (>= 3.4.0)

  conjunto de ferramentas OpenGL

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: libx11-6 [sparc64]

  biblioteca para o cliente X11

• dep: libxi6 [sparc64]

  Biblioteca de extensão da entrada X11

Download de maqview

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	0.2.5-12	120.3 kB	1,084.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	0.2.5-12	116.6 kB	904.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.2.5-12	109.6 kB	953.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.2.5-12	98.9 kB	772.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.2.5-12	99.1 kB	660.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	0.2.5-12	112.9 kB	819.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.2.5-12	125.3 kB	908.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	0.2.5-11	144.8 kB	1,389.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	0.2.5-12	113.0 kB	889.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	0.2.5-12	102.1 kB	776.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.2.5-12	116.5 kB	1,114.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	0.2.5-12	125.5 kB	1,146.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.2.5-12	124.0 kB	1,144.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.2.5-12	120.0 kB	785.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.2.5-12	117.4 kB	932.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	0.2.5-12	118.7 kB	888.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	0.2.5-12	99.4 kB	4,418.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	0.2.5-12	116.3 kB	848.0 kB	[lista de arquivos]