パッケージ: maqview (0.2.5-12 など)

[ ソース: maqview  ]

graphical read alignment viewer for short gene sequences

Maqview is graphical read alignment viewer. It is specifically designed for the Maq alignment file and allows you to see the mismatches, base qualities and mapping qualities. Maqview is nothing fancy as Consed or GAP, but just a simple viewer for you to see what happens in a particular region.

In comparison to tgap-maq, the text-based read alignment viewer written by James Bonfield, Maqview is faster and takes up much less memory and disk space in indexing. This is possibly because tgap aims to be a general-purpose viewer but Maqview fully makes use of the fact that a Maq alignment file has already been sorted. Maqview is also efficient in viewing and provides a command-line tool to quickly retrieve any region in an Maq alignment file.

その他の maqview 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sh4, sparc64]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgl1

  ベンダー中立な GL ディスパッチライブラリ -- 旧式 GL サポート

• dep: libglu1-mesa

  Mesa OpenGL ユーティリティライブラリ (GLU)

  または libglu1

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libglu1-mesa

• dep: libglut3.12 (>= 3.4.0)

  OpenGL Utility Toolkit

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libx11-6 [sparc64]

  X11 クライアントサイドライブラリ

• dep: libxi6 [sparc64]

  X11 Intput 拡張ライブラリ

maqview のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.2.5-12	120.3 kB	1,084.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.2.5-12	116.6 kB	904.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.2.5-12	109.6 kB	953.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.2.5-12	98.9 kB	772.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.2.5-12	99.1 kB	660.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.2.5-12	112.9 kB	819.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.2.5-12	125.3 kB	908.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.2.5-11	144.8 kB	1,389.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.2.5-12	102.1 kB	776.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.2.5-12	116.5 kB	1,114.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.2.5-12	125.5 kB	1,146.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.2.5-12	124.0 kB	1,144.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.2.5-12	120.0 kB	785.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.2.5-12	117.4 kB	932.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.2.5-12	118.7 kB	888.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.2.5-12	99.4 kB	4,418.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.2.5-12	116.3 kB	848.0 kB	[ファイル一覧]