Paket: maqview (0.2.5-12 och andra)

[ Källkod: maqview  ]

graphical read alignment viewer for short gene sequences

Maqview is graphical read alignment viewer. It is specifically designed for the Maq alignment file and allows you to see the mismatches, base qualities and mapping qualities. Maqview is nothing fancy as Consed or GAP, but just a simple viewer for you to see what happens in a particular region.

In comparison to tgap-maq, the text-based read alignment viewer written by James Bonfield, Maqview is faster and takes up much less memory and disk space in indexing. This is possibly because tgap aims to be a general-purpose viewer but Maqview fully makes use of the fact that a Maq alignment file has already been sorted. Maqview is also efficient in viewing and provides a command-line tool to quickly retrieve any region in an Maq alignment file.

Andra paket besläktade med maqview

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sh4, sparc64]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgl1

  Vendor neutral GL dispatch library -- legacy GL support

• dep: libglu1-mesa

  Mesa OpenGL utility library (GLU)

  eller libglu1

  virtuellt paket som tillhandahålls av libglu1-mesa

• dep: libglut3.12 (>= 3.4.0)

  OpenGL Utility Toolkit

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: libx11-6 [sparc64]

  X11 client-side library

• dep: libxi6 [sparc64]

  X11 Input extension library

Hämta maqview

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.2.5-12	120,3 kbyte	1.084,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.2.5-12	116,6 kbyte	904,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.2.5-12	109,6 kbyte	953,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.2.5-12	98,9 kbyte	772,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.2.5-12	99,1 kbyte	660,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.2.5-12	112,9 kbyte	819,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.2.5-12	125,3 kbyte	908,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.2.5-11	144,8 kbyte	1.389,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.2.5-12	102,1 kbyte	776,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.2.5-12	116,5 kbyte	1.114,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.2.5-12	125,5 kbyte	1.146,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.2.5-12	124,0 kbyte	1.144,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.2.5-12	120,0 kbyte	785,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.2.5-12	117,4 kbyte	932,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.2.5-12	118,7 kbyte	888,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.2.5-12	99,4 kbyte	4.418,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.2.5-12	116,3 kbyte	848,0 kbyte	[filförteckning]