Pacote: libfreecontact0t64 (1.0.21-14 e outros)

[ Fonte: freecontact  ]

fast protein contact predictor library

FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011).

FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible.

A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input.

jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example.

This package contains the shared library implementing freecontact.

Outros pacotes relacionados a libfreecontact0t64

• dep: libblas3

  Implementações de Referências Básicas de Álgebra Linear , Biblioteca compartilhada

  ou libblas.so.3

  pacote virtual fornecido por libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgfortran5 (>= 8)

  biblioteca de execução para aplicações GNU Fortran

• dep: libgomp1 (>= 6)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblapack3

  Biblioteca de rotinas de álgebra linear 3 - versão compartilhada

  ou liblapack.so.3

  pacote virtual fornecido por libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

Download de libfreecontact0t64

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.0.21-14	75.4 kB	219.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.0.21-14	81.6 kB	206.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.0.21-14	72.9 kB	218.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.0.21-14	61.5 kB	165.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.0.21-14	61.7 kB	129.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.0.21-14+b1	79.7 kB	202.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.0.21-14	67.8 kB	181.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.0.21-13.1+b1	97.4 kB	319.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.0.21-14	73.9 kB	185.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.0.21-14	60.0 kB	161.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.0.21-14	68.7 kB	224.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.0.21-14	77.3 kB	218.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.0.21-14	87.3 kB	218.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.0.21-14	74.2 kB	149.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.0.21-14	70.3 kB	202.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.0.21-14	80.5 kB	217.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.0.21-14	62.5 kB	1,053.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.0.21-14	81.8 kB	201.0 kB	[lista de arquivos]