Пакет: libfreecontact0t64 (1.0.21-14 и другие)

[ Источник: freecontact  ]

fast protein contact predictor library

FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011).

FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible.

A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input.

jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example.

This package contains the shared library implementing freecontact.

Другие пакеты, относящиеся к libfreecontact0t64

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgfortran5 (>= 8)

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: libgomp1 (>= 6)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblapack3

  библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

  или liblapack.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

Загрузка libfreecontact0t64

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.0.21-14	75,4 Кб	219,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.0.21-14	81,6 Кб	206,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0.21-14	72,9 Кб	218,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0.21-14	61,5 Кб	165,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0.21-14	61,7 Кб	129,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.0.21-14+b1	79,7 Кб	202,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0.21-14	67,8 Кб	181,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1+b1	97,4 Кб	319,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.0.21-14	60,0 Кб	161,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0.21-14	68,7 Кб	224,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.0.21-14	77,3 Кб	218,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0.21-14	87,3 Кб	218,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0.21-14	74,2 Кб	149,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0.21-14	70,3 Кб	202,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.0.21-14	80,5 Кб	217,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.0.21-14	62,5 Кб	1 053,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.0.21-14	81,8 Кб	201,0 Кб	[список файлов]