Package: tabix (1.21+ds-0+exp2)
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Similar packages:
Experimental package
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indexador genérico para arquivos de posicionamento de genoma delimitados por TAB
Tabix indexa arquivos nos quais algumas colunas indicam coordenadas de sequência: nome (em geral um cromossomo), começo e fim. Os dados de entrada devem ser ordenados pela posição e comprimidos com bgzip (fornecido neste pacote), que tem uma interface semelhante ao gzip. Depois da indexação, tabix pode recuperar rapidamente linhas de dados por coordenadas de cromossomos. A recuperação rápida de dados também se dá por rede se uma URI for dada como nome de arquivo.
Este pacote foi construído com a fonte HTSlib, e fornece as ferramentas bgzip, htsfile e tabix.
Other Packages Related to tabix
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- dep: libbz2-1.0
- bib. de alta qualid. de compactação de arqs. bas. em ordenação de blocos - exec
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- compressor e descompressor derivado de DEFLATE rápido e de buffer inteiro
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- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- biblioteca de compressão para formato XZ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)
Download tabix
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| s390x | 472.1 kB | 2,504.0 kB | [list of files] |