Pacote: examl (3.0.22-4~0exp) [debports]

[ Fonte:  ]

Pacote experimental

Aviso: este pacote é da distribuição experimental. Isso significa que provavelmente é instável ou tem erros, e pode até causar perda de dados. Certifique-se de consultar o changelog e outras documentações antes de usá-lo.

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) is a code for phylogenetic inference using MPI. This code implements the popular RAxML search algorithm for maximum likelihood based inference of phylogenetic trees.

ExaML is a strapped-down light-weight version of RAxML for phylogenetic inference on huge datasets. It can only execute some very basic functions and is intended for computer-savvy users that can write little perl-scripts and have experience using queue submission scripts for clusters. ExaML only implements the CAT and GAMMA models of rate heterogeneity for binary, DNA, and protein data.

ExaML uses a radically new MPI parallelization approach that yields improved parallel efficiency, in particular on partitioned multi-gene or whole-genome datasets. It also implements a new load balancing algorithm that yields better parallel efficiency.

It is up to 4 times faster than its predecessor RAxML-Light and scales to a larger number of processors.

Outros pacotes relacionados a examl

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: openmpi-bin

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

Download de examl

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
riscv64 (porte não oficial)	824.8 kB	1,541.0 kB	[lista de arquivos]