Pacote: python-htseq (0.11.2-1)

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Fontes externas:

Pagina principal [www-huber.embl.de]

Pacotes similares:

Python high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

This package contains the Python 2 module.

Pacotes fornecendo python-htseq

python3-htseq: Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

Outros pacotes relacionados a python-htseq

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

Biblioteca de suporte GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

Biblioteca C++ padrão da GNU v3
dep: python

linguagem interativa de alto nível orientada a objetos (versão Python2)

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7)
dep: python-numpy

Python numérico adiciona uma funcionalidade de array rápida na linguagem Python
dep: python-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)

Download de python-htseq

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	226.0 kB	791.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	187.5 kB	760.0 kB	[lista de arquivos]