[ Paquet source : htseq ]
Paquet : python-htseq (0.11.2-1)
Liens pour python-htseq
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source htseq :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Diane Trout (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [www-huber.embl.de]
Paquets similaires :
Python high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to study the data quality. * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in a genome browser. * Reading in annotation data from a GFF file. * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and genes.
This package contains the Python 2 module.
Paquets fournissant python-htseq
- python3-htseq
- Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
Autres paquets associés à python-htseq
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: python
- langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)
- dep: python (<< 2.8)
- dep: python (>= 2.7)
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- dep: python-numpy
- gestion rapide des tableaux avec Python
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- dep: python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
Télécharger python-htseq
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 226,0 ko | 791,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 187,5 ko | 760,0 ko | [liste des fichiers] |