Pacote: kissplice (2.4.0-p1-4)

[ Fonte: kissplice  ]

Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data

KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.

Outros pacotes relacionados a kissplice

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: python

  linguagem interativa de alto nível orientada a objetos (versão Python2)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de kissplice

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	770.0 kB	1,398.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	755.5 kB	1,334.0 kB	[lista de arquivos]