Pacote: deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3)

[ Fonte: deepnano  ]

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Outros pacotes relacionados a deepnano

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: python

  linguagem interativa de alto nível orientada a objetos (versão Python2)

• dep: python-dateutil

  powerful extensions to the standard Python datetime module

• dep: python-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)

• dep: python-numpy

  Python numérico adiciona uma funcionalidade de array rápida na linguagem Python

• dep: python-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python

• rec: python-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events - Python 2.x

Download de deepnano

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	19.9 kB	97.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	19.4 kB	89.0 kB	[lista de arquivos]
i386	20.5 kB	95.0 kB	[lista de arquivos]