Pacote: deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3.1)

[ Fonte: deepnano  ]

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Outros pacotes relacionados a deepnano

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [não armhf]

  Pacote não disponível

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: python3

  linguagem orientada a objetos de alto nível e interativa (versão padrão da python3)

• dep: python3-dateutil

  powerful extensions to the standard Python 3 datetime module

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python 3

• rec: python3-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events

Download de deepnano

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	20.1 kB	98.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	19.7 kB	90.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	19.0 kB	80.0 kB	[lista de arquivos]
i386	20.6 kB	96.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	21.8 kB	194.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	19.8 kB	90.0 kB	[lista de arquivos]