Paket: deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3)

[ Quellcode: deepnano  ]

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Andere Pakete mit Bezug zu deepnano

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: python

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)

• dep: python-dateutil

  Leistungsfähige Erweiterungen für das Python-Standardmodul datetime

• dep: python-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)

• dep: python-numpy

  Numerical Python fügt der Sprache Python eine schnelle Array-Einrichtung hinzu

• dep: python-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python

• rec: python-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events - Python 2.x

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	19,9 kB	97,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	19,4 kB	89,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	20,5 kB	95,0 kB	[Liste der Dateien]