Package: hmmer2 (2.3.2+dfsg-6)

[ Source: hmmer2  ]

perfis "hidden Markov models" para análise de seqüência de proteína

HMMER é uma implementação do métodos de perfil "hidden Markov model" (modelo Markov oculto) para buscas sensíveis de bases de dados de seqüências biológicas usando múltiplas seqüências de alinhamento como consultas.

Dada uma múltipla seqüência de alinhamento como entrada, HMMER constrói um modelo estatístico chamado "hidden Markov model" (modelo Markov oculto) que pode então ser usado como uma consulta em um banco de dados de seqüências para encontrar (e/ou alinhar) homólogos adicionais da família da seqüência.

Other Packages Related to hmmer2

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libpvm3

  Parallel Virtual Machine - shared libraries

• dep: libsquid1

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  utilities for biological sequence analysis

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-6)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

• sug: hmmer2-pvm (>= 2.3.2+dfsg-6)

  programas HMMER com suporte a PVM (Parallel Virtual Machine)

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