Paket: deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3.1)

[ Quellcode: deepnano  ]

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Andere Pakete mit Bezug zu deepnano

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nicht armhf]

  Paket nicht verfügbar

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: python3

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)

• dep: python3-dateutil

  Leistungsfähige Erweiterungen für das Python-3-Standardmodul datetime

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-numpy

  Schnelle Array-Einrichtung für die Sprache Python 3

• dep: python3-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python 3

• rec: python3-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events

deepnano herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	20,1 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	19,7 kB	90,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	19,0 kB	80,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	20,6 kB	96,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	21,8 kB	194,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	19,8 kB	90,0 kB	[Liste der Dateien]