Пакет: autodock (4.2.6-9)

[ Източник: autodocksuite  ]

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Етикети: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

Други пакети, свързани с autodock

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf, ppc64el]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• sug: autogrid

  pre-calculate binding of ligands to their receptor

Изтегляне на autodock

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	163,5 кБ	411,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	150,7 кБ	375,0 кБ	[списък на файловете]
armel	156,7 кБ	403,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	151,7 кБ	315,0 кБ	[списък на файловете]
i386	161,5 кБ	411,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	165,0 кБ	460,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	170,5 кБ	454,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	164,4 кБ	435,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	149,3 кБ	395,0 кБ	[списък на файловете]