Pakiet: trf (4.09.1-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: trf  ]

locate and display tandem repeats in DNA sequences

A tandem repeat in DNA is two or more adjacent, approximate copies of a pattern of nucleotides. Tandem Repeats Finder is a program to locate and display tandem repeats in DNA sequences. In order to use the program, the user submits a sequence in FASTA format. There is no need to specify the pattern, the size of the pattern or any other parameter. The output consists of two files: a repeat table file and an alignment file. The repeat table, viewable in a web browser, contains information about each repeat, including its location, size, number of copies and nucleotide content. Clicking on the location indices for one of the table entries opens a second browser page that shows an alignment of the copies against a consensus pattern. The program is very fast, analyzing sequences on the order of .5Mb in just a few seconds. Submitted sequences may be of arbitrary length. Repeats with pattern size in the range from 1 to 2000 bases are detected.

Inne pakiety związane z trf

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

Pobieranie trf

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	4.09.1-6	56,9 KiB	167,0 KiB	[lista plików]
arm64	4.09.1-6+b1	53,5 KiB	184,0 KiB	[lista plików]
armel	4.09.1-6	55,4 KiB	182,0 KiB	[lista plików]
armhf	4.09.1-6	53,0 KiB	182,0 KiB	[lista plików]
i386	4.09.1-6	55,7 KiB	166,0 KiB	[lista plików]
mips64el	4.09.1-6	55,3 KiB	187,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	4.09.1-6	58,0 KiB	183,0 KiB	[lista plików]
riscv64	4.09.1-6+b1	55,4 KiB	148,0 KiB	[lista plików]
s390x	4.09.1-6	53,8 KiB	163,0 KiB	[lista plików]