Pakiet: python3-unifrac (1.3-2)

[ Pakiet źródłowy: unifrac  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains the Python3 module.

Inne pakiety związane z python3-unifrac

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el]

• dep: libssu0 (>= 1.4)

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-biom-format

  Biological Observation Matrix (BIOM) format (Python 3)

• dep: python3-h5py (>= 3.3.0)

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-iow

  balanced parentheses tree structure

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-skbio (>= 0.5.8-3~)

  Python3 data structures, algorithms, educational resources for bioinformatic

Pobieranie python3-unifrac

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	182,3 KiB	895,0 KiB	[lista plików]
arm64	161,3 KiB	975,0 KiB	[lista plików]
mips64el	152,2 KiB	987,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	182,0 KiB	1 039,0 KiB	[lista plików]