Pakiet: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5)

[ Pakiet źródłowy: tvc  ]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Inne pakiety związane z tvc

• dep: libarmadillo11 (>= 1:11.2.3+dfsg)

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie tvc

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 049,1 KiB	3 361,0 KiB	[lista plików]
arm64	970,3 KiB	3 221,0 KiB	[lista plików]
armel	940,3 KiB	3 089,0 KiB	[lista plików]
armhf	955,9 KiB	2 705,0 KiB	[lista plików]
i386	1 089,4 KiB	3 452,0 KiB	[lista plików]
mips64el	989,1 KiB	3 755,0 KiB	[lista plików]
mipsel	993,0 KiB	3 608,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 060,5 KiB	3 733,0 KiB	[lista plików]
s390x	977,7 KiB	3 396,0 KiB	[lista plików]