Pakiet: provean (1.1.5+ds-2)

[ Pakiet źródłowy: provean  ]

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Inne pakiety związane z provean

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, mipsel]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie provean

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	48,1 KiB	141,0 KiB	[lista plików]
arm64	44,7 KiB	125,0 KiB	[lista plików]
armel	45,4 KiB	132,0 KiB	[lista plików]
armhf	47,1 KiB	108,0 KiB	[lista plików]
i386	51,0 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
mips64el	49,9 KiB	166,0 KiB	[lista plików]
mipsel	50,1 KiB	160,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	48,8 KiB	153,0 KiB	[lista plików]
s390x	44,1 KiB	137,0 KiB	[lista plików]